
Chimie Médicinale/Synthèse
organique
|
|
|
|
|
|
|
Chimie médicinale
Les étudiants que nous formons se dirigent généralement vers l'industrie pharmaceutique. A cette fin, nous conçevons une approche et une formation multidisciplinaires axées sur les interactions ligands-récepteurs. Nous concentrons nos efforts sur la conception de molécules thérapeutiques ayant des activités anti-virales et anti-microbiennes, pouvant intervenir dans l'apoptose impliquée lors de cancers (inhibiteurs des galectines), pouvant stimuler la réponse immunitaire et, finalement, pouvant intervenir lors du rejet de xénotransplantation du foie. Nous avons également un programme axé sur les produits naturels et leurs propriétés médicinales. A cette fin, nous avons une collaboration étroite avec les pays de l'Afrique de l'Ouest.
Méthodologie de synthèse
Afin de construire de petites librairies de structures pharmacophores pour l'etude QSAR (Quantitative Struture Activity Relationship), nous utilisons la chimie combinatoire en mode parallèle. Nous développons également la métathèse d'oléfines en utilisant le catalyseur de Grubbs (Ruthénium) et nous effectuons des couplages croisés avec le palladium (Heck, Suzuki, Sonogashira). Nous sommes particulièment intéressés par les C-glycosides et leurs mimétiques afin de pourvoir au programme de chimie médicinale ci-dessus. La synthèse asymmétrique par induction chirale et l'utilisation de catalyseurs chiraux constituts aussi un sujet en expansion. La figure dans le cadre ci-dessus résulte d'une cycloaddition [1,3]-dipolaire entre un dérivé azidure et un alcyne, l'acide propiolique. Ce type de glycomimétique a pour but d'augmenter les propriétés pharmacodynamiques des glycanes.
Reconnaissance moléculaire
La préparation de vaccins à base de carbohydrates, efficaces en médecine humaine ou vétérinaire, exige une compréhension adéquate des interactions antigène-anticorps au niveau moléculaire. L'étude des relations entre la structure et l'activité biologiques se fait par des modifications chimiques ou par la synthèses de déterminants antigéniques. Afin d'obtenir les informations nécessaires pour l'étude de sites actifs, l'analyse conformationelle, le nombre d'antigènes présents, leur accessibilité, ainsi que le choix de la protéine porteuse constituent quelques uns des aspects de la recherche fondamentale impliquée. De nouvelles structures dendritiques et glycopolymèriques sont synthétisées comme agents thérapeutiques et diagnostiques ayant une actibité biologique contre le virus de la grippe, les cancers de la peau et du sein, ainsi que des infections pathogènes (E. coli, Pseudomonas aeruginosa).
2002-2003
177. Sashiwa, H.; Shigemasa, Y.; Roy, R. Chemical modification of Chitosan. 8.
Preparation of Chitosan-dendrimer Hybrids via Short Spacer. Carbohydr.
Polymer. 2002, 47, 191-199.
178. Sashiwa, H.; Shigemasa, Y.; Roy, R. Chemical modification of Chitosan. 9.
Reaction of N-Carboxyethyl Chitosan Methyl Ester with diamines or Acetal
Ending PAMAM Dendrimers. Carbohydr. Polymer. 2002, 47,
201-208.
179. Baek, M.-G; Roy,
R. Synthesis and Protein Binding properties of T-Antigen Containing
GlycoPAMAM Dendrimers. Bioorg. Med. Chem. 2002, 10, 11-17.
180. Baek, M.-G., Roy,
R. Glycodendrimers: novel glycotope isosteres unmasking sugar coding.
Case study with T-Antigen Markers from Breast Cancer MUC1 Glycoprotein. Rev.
Molec. Biotechnol., 2002, 90, 291-309
181. Dominique, R.; Roy, R. Stereoselective Synthesis of Glycoclusters
Using an Olefin Metathesis and Sharpless Dihydroxylation Sequence. Tetrahedron
Lett. 2002, 43, 395-398.
182. Dam, T. K.; Roy,
R.; Pagé, D.; Brewer, C. F. Negative Cooperativity Associated
with Binding of Multivalent Carbohydrates to Lectins. Thermodynamic Analysis
of the "Multivalent Effect". Biochemistry, 2002, 41,
1351-1358.
183. Dam, T. K.; Roy,
R.; Pagé, D.; Brewer, C. F. Thermodynamic Binding Parameters
of Individual Epitopes of Multivalent Carbohydrates to Concanavalin
A as Determined by "Reverse" Isothermal Titration Microcalorimetry.
Biochemistry, 2002, 41, 1359-1363.
(184) Sashiwa, H.; Shigemasa, Y.; Roy,
R. Chemical modification of Chitosan. 11. Chitosan-Dendrimer Hybrids
as a Tree Like Molecule. Carbohydr. Polymer. 2002, 49,
195-205.
185. Gan, Z.,; Roy,
R. Sialoside Clusters as Potential Ligands for Siglecs (Sialoadhesins).
Can. J. Chem., 2002, 80, 908-916.
186. Liu, B.; Roy,
R. Olefin Self-metathesis as a New Entry Into Xenotransplantation
Antagonists Bearing the Galili Antigen. Chem. Commun. 2002,
594-595.
187. Schmor, B.; Roy,
R. A New Palladium-catalyzed Phenyl-alkene Bond Formation. Molecules,
2002, 7, 433-436.
188. Liu, B.; Das, S. K.: Roy, R. Efficient Ruthenium Carbenoid Catalyzed
Cross-metathesis of Allyl Halides with Olefins. Org. Lett., 2002,
4, 2723-2726.
189. Nagahori, N.; Lee, R. T.; Nishimura, S.-I;
Pagé, D.; Roy, R.; Lee, Y. C. Inhibition
of Adhesion of Type 1-Fimbriated Escherichia coli to Highly Mannosylated Ligands.
ChemBioChem. 2002, 3, 836-844.
190. Siebert, H.-C.; Lü, S.-Y.; Frank, M.;
Kramer, J.; Wechselberger, R.; Joosten, J.; André, S.; Rittenhouse-Diakun,
K.; Roy, R.; von der Lieth, C.-W.; Kaptein,
R.; Vliegenthart, J. F. G.; Heck, A. J. R.; Gabius, H.-J. Analysis of protein-Carbohydrate
Interaction at the Lower Size Limit of the Protein Part (15-Mer Peptide)
by NMR Spectroscopy, Electrospray Ionization Mass Spectrometry and Molecular
Modeling. Biochemistry., 2002, 41, 9707-9717.
191. Das, S. K.; Trono, C. M.; Roy, R. Palladium-catalyzed Cross-coupling Toward
the Synthesis of ?-D-Mannopyranoside Clusters. Methods Enzymol., Y.
C. Lee, R. T. Lee (Eds.), Academic Press, in press.
192. Liu, B.; Roy,
R. Comparative Studies of Galactoside-containing Clusters.
Methods Enzymol., Y. C. Lee, R. T. Lee (Eds.), Academic Press, in
press.
193. Dominique, R.; Das, S. K., Roy, R. Ruthenium Carbenoids as Catalyst for
Olefin Metathesis of alpha-Alkyl Glycosides. Methods Enzymol., Y. C.
Lee, R. T. Lee (Eds.), Academic Press, in press.
194. Roy, R.;
Baek, M.-G. Multivalent Breast Cancer T-Antigen Markers Scaffolded Onto PAMAM
Dendrimers. Methods Enzymol., Y. C. Lee, R. T. Lee (Eds.), Academic
Press, in press.
195. Roy, R
.; Sashiwa, H. Synthesis of dendronized and Dendrimerized Chitosan-sialic
Acid Hybrids Toward the Inhibition of Flu Virus Hemafflutination. Top.
Curr. Chem., invited contribution.
196. Sklenár, J.; Sopko, B.; Horváth,
O.; Fišerová, A.; Pospíšil, M.; Havlícek,
V.; Kren, V.; Lindhorst, T. K.; Roy, R.;
Bezouška, K. Threshold clustering of beta-N-Acetyl-D-glucosamine is required
for activation of rat NK cells through CD161 (NKR-P1A) receptor. J. Immunol.,
2002, submitted.
197. Roy, R.;
Kim, J. M. Cu(II)-Self-assembling Bipyridyl-glycoclusters and Dendrimers Bearing
the TN-Antigen Cancer Marker: Syntheses and Lectin Binding Properties. Tetrahedron,
(invited contribution to a Special issue on dendrimer). Submitted.